Here is a list of all documented functions, variables, defines, enums, and typedefs with links to the documentation:

- a -

• APBS_TIMER_ENERGY : vhal.h
• APBS_TIMER_FORCE : vhal.h
• APBS_TIMER_SETUP : vhal.h
• APBS_TIMER_SOLVER : vhal.h
• APBS_TIMER_TEMP1 : vhal.h
• APBS_TIMER_TEMP2 : vhal.h
• APBS_TIMER_WALL_CLOCK : vhal.h
• APBSRC : routines.h
• AtomForce : routines.h

- b -

• BCFL_FOCUS : vhal.h
• BCFL_MDH : vhal.h
• BCFL_SDH : vhal.h
• BCFL_UNUSED : vhal.h
• BCFL_ZERO : vhal.h
• Bmat_printHB() : vfetk.h

- c -

• CLIST_AUTO_DOMAIN : vclist.h
• CLIST_MANUAL_DOMAIN : vclist.h

- e -

• eFEMparm_CalcType : femparm.h
• eFEMparm_EstType : femparm.h
• eFEMparm_EtolType : femparm.h
• eMGparm_CalcType : mgparm.h
• eMGparm_CentMeth : mgparm.h
• energyFE() : routines.h
• energyMG() : routines.h
• eNOsh_CalcType : nosh.h
• eNOsh_MolFormat : nosh.h
• eNOsh_ParmFormat : nosh.h
• eNOsh_PrintType : nosh.h
• ePBEparm_calcEnergy : pbeparm.h
• ePBEparm_calcForce : pbeparm.h
• eVbcfl : vhal.h
• eVchrg_Meth : vhal.h
• eVclist_DomainMode : vclist.h
• eVdata_Format : vhal.h
• eVdata_Type : vhal.h
• eVfetk_GuessType : vfetk.h
• eVfetk_LsolvType : vfetk.h
• eVfetk_NsolvType : vfetk.h
• eVfetk_PrecType : vfetk.h
• eVhal_PBEType : vhal.h
• eVsurf_Meth : vhal.h
• EXPMAX : vcap.h
• EXPMIN : vcap.h

- f -

• FCT_MAN : femparm.h
• FEMparm : femparm.h
• FEMparm_CalcType : femparm.h
• FEMparm_check() : femparm.h
• FEMparm_ctor() : femparm.h
• FEMparm_ctor2() : femparm.h
• FEMparm_dtor() : femparm.h
• FEMparm_dtor2() : femparm.h
• FEMparm_EstType : femparm.h
• FEMparm_EtolType : femparm.h
• FEMparm_parseToken() : femparm.h
• FET_FRAC : femparm.h
• FET_GLOB : femparm.h
• FET_SIMP : femparm.h
• forceMG() : routines.h
• FRT_DUAL : femparm.h
• FRT_GEOM : femparm.h
• FRT_LOCA : femparm.h
• FRT_RESI : femparm.h
• FRT_UNIF : femparm.h

- g -

• Gem_setExternalUpdateFunction() : vcsm.h

- i -

• initFE() : routines.h
• initMG() : routines.h

- k -

• killChargeMaps() : routines.h
• killDielMaps() : routines.h
• killEnergy() : routines.h
• killForce() : routines.h
• killKappaMaps() : routines.h
• killMG() : routines.h
• killMolecules() : routines.h

- l -

• loadChargeMaps() : routines.h
• loadDielMaps() : routines.h
• loadKappaMaps() : routines.h
• loadMolecules() : routines.h

- m -

• MAXFOCUS : vhal.h
• MAXION : vhal.h
• MAXMOL : vhal.h
• MCM_MOL : mgparm.h
• MCM_PNT : mgparm.h
• MCT_AUT : mgparm.h
• MCT_DUM : mgparm.h
• MCT_MAN : mgparm.h
• MCT_PAR : mgparm.h
• MGparm : mgparm.h
• MGparm_CalcType : mgparm.h
• MGparm_CentMeth : mgparm.h
• MGparm_check() : mgparm.h
• MGparm_copy() : mgparm.h
• MGparm_ctor() : mgparm.h
• MGparm_ctor2() : mgparm.h
• MGparm_dtor() : mgparm.h
• MGparm_dtor2() : mgparm.h
• MGparm_getCenterX() : mgparm.h
• MGparm_getCenterY() : mgparm.h
• MGparm_getCenterZ() : mgparm.h
• MGparm_getHx() : mgparm.h
• MGparm_getHy() : mgparm.h
• MGparm_getHz() : mgparm.h
• MGparm_getNx() : mgparm.h
• MGparm_getNy() : mgparm.h
• MGparm_getNz() : mgparm.h
• MGparm_getPartOlapCenterShiftX() : mgparm.h
• MGparm_getPartOlapCenterShiftY() : mgparm.h
• MGparm_getPartOlapCenterShiftZ() : mgparm.h
• MGparm_parseToken() : mgparm.h
• MGparm_setCenterX() : mgparm.h
• MGparm_setCenterY() : mgparm.h
• MGparm_setCenterZ() : mgparm.h

- n -

• NCT_FEM : nosh.h
• NCT_MG : nosh.h
• NMF_PDB : nosh.h
• NMF_PQR : nosh.h
• NOsh : nosh.h
• NOsh_calc : nosh.h
• NOsh_CalcType : nosh.h
• NOsh_ctor() : nosh.h
• NOsh_ctor2() : nosh.h
• NOsh_dtor() : nosh.h
• NOsh_dtor2() : nosh.h
• NOsh_elec2calc() : nosh.h
• NOsh_elecname() : nosh.h
• NOsh_getCalc() : nosh.h
• NOsh_getChargefmt() : nosh.h
• NOsh_getChargepath() : nosh.h
• NOsh_getDielfmt() : nosh.h
• NOsh_getDielXpath() : nosh.h
• NOsh_getDielYpath() : nosh.h
• NOsh_getDielZpath() : nosh.h
• NOsh_getKappafmt() : nosh.h
• NOsh_getKappapath() : nosh.h
• NOsh_getMolpath() : nosh.h
• NOSH_MAXCALC : nosh.h
• NOSH_MAXMOL : nosh.h
• NOSH_MAXPOP : nosh.h
• NOSH_MAXPRINT : nosh.h
• NOsh_MolFormat : nosh.h
• NOsh_ParmFormat : nosh.h
• NOsh_parse() : nosh.h
• NOsh_parseFile() : nosh.h
• NOsh_printCalc() : nosh.h
• NOsh_printNarg() : nosh.h
• NOsh_printOp() : nosh.h
• NOsh_PrintType : nosh.h
• NOsh_printWhat() : nosh.h
• NOsh_setupMGAUTO() : nosh.h
• NOsh_setupMGMANUAL() : nosh.h
• NOsh_setupMGPARA() : nosh.h
• npenergyMG() : routines.h
• NPF_FLAT : nosh.h
• NPT_ENERGY : nosh.h
• NPT_FORCE : nosh.h

- p -

• partFE() : routines.h
• PBE_LPBE : vhal.h
• PBE_LRPBE : vhal.h
• PBE_NPBE : vhal.h
• PBE_NRPBE : vhal.h
• PBEparm : pbeparm.h
• PBEparm_calcEnergy : pbeparm.h
• PBEparm_calcForce : pbeparm.h
• PBEparm_check() : pbeparm.h
• PBEparm_copy() : pbeparm.h
• PBEparm_ctor() : pbeparm.h
• PBEparm_ctor2() : pbeparm.h
• PBEparm_dtor() : pbeparm.h
• PBEparm_dtor2() : pbeparm.h
• PBEparm_getIonCharge() : pbeparm.h
• PBEparm_getIonConc() : pbeparm.h
• PBEparm_getIonRadius() : pbeparm.h
• PBEPARM_MAXWRITE : pbeparm.h
• PBEparm_parseToken() : pbeparm.h
• PCE_COMPS : pbeparm.h
• PCE_NO : pbeparm.h
• PCE_TOTAL : pbeparm.h
• PCF_COMPS : pbeparm.h
• PCF_NO : pbeparm.h
• PCF_TOTAL : pbeparm.h
• postRefineFE() : routines.h
• preRefineFE() : routines.h
• printEnergy() : routines.h
• printFEPARM() : routines.h
• printForce() : routines.h
• printMGPARM() : routines.h
• printPBEPARM() : routines.h

- s -

• setPartMG() : routines.h
• solveFE() : routines.h
• solveMG() : routines.h
• startVio() : routines.h

- u -

• USEHB : routines.h

- v -

• Vacc : vacc.h
• Vacc_atomSASA() : vacc.h
• Vacc_atomSASPoints() : vacc.h
• Vacc_atomSurf() : vacc.h
• Vacc_ctor() : vacc.h
• Vacc_ctor2() : vacc.h
• Vacc_dtor() : vacc.h
• Vacc_dtor2() : vacc.h
• Vacc_fastMolAcc() : vacc.h
• Vacc_ivdwAcc() : vacc.h
• Vacc_memChk() : vacc.h
• Vacc_molAcc() : vacc.h
• Vacc_SASA() : vacc.h
• Vacc_splineAcc() : vacc.h
• Vacc_splineAccAtom() : vacc.h
• Vacc_splineAccGrad() : vacc.h
• Vacc_splineAccGradAtomNorm() : vacc.h
• Vacc_splineAccGradAtomUnnorm() : vacc.h
• Vacc_totalSASA() : vacc.h
• Vacc_vdwAcc() : vacc.h
• VaccSurf : vacc.h
• VaccSurf_ctor() : vacc.h
• VaccSurf_ctor2() : vacc.h
• VaccSurf_dtor() : vacc.h
• VaccSurf_dtor2() : vacc.h
• VaccSurf_refSphere() : vacc.h
• Valist : valist.h
• Valist_ctor() : valist.h
• Valist_ctor2() : valist.h
• Valist_dtor() : valist.h
• Valist_dtor2() : valist.h
• Valist_getAtom() : valist.h
• Valist_getAtomList() : valist.h
• Valist_getCenterX() : valist.h
• Valist_getCenterY() : valist.h
• Valist_getCenterZ() : valist.h
• Valist_getNumberAtoms() : valist.h
• Valist_memChk() : valist.h
• Valist_readPDB() : valist.h
• Valist_readPQR() : valist.h
• VAPBS_BACK : vhal.h
• VAPBS_DIM : vhal.h
• VAPBS_DOWN : vhal.h
• VAPBS_FRONT : vhal.h
• VAPBS_LEFT : vhal.h
• VAPBS_NVS : vhal.h
• VAPBS_RIGHT : vhal.h
• VAPBS_UP : vhal.h
• Vatom : vatom.h
• Vatom_copyFrom() : vatom.h
• Vatom_copyTo() : vatom.h
• Vatom_ctor() : vatom.h
• Vatom_ctor2() : vatom.h
• Vatom_dtor() : vatom.h
• Vatom_dtor2() : vatom.h
• Vatom_getCharge() : vatom.h
• Vatom_getPartID() : vatom.h
• Vatom_getPosition() : vatom.h
• Vatom_getRadius() : vatom.h
• Vatom_memChk() : vatom.h
• Vatom_setAtomID() : vatom.h
• Vatom_setCharge() : vatom.h
• Vatom_setPartID() : vatom.h
• Vatom_setPosition() : vatom.h
• Vatom_setRadius() : vatom.h
• Vbcfl : vhal.h
• Vcap_cosh() : vcap.h
• Vcap_exp() : vcap.h
• Vcap_sinh() : vcap.h
• Vchrg_Meth : vhal.h
• Vclist : vclist.h
• Vclist_ctor() : vclist.h
• Vclist_ctor2() : vclist.h
• Vclist_DomainMode : vclist.h
• Vclist_dtor() : vclist.h
• Vclist_dtor2() : vclist.h
• Vclist_getCell() : vclist.h
• Vclist_maxRadius() : vclist.h
• Vclist_memChk() : vclist.h
• VclistCell : vclist.h
• VclistCell_ctor() : vclist.h
• VclistCell_ctor2() : vclist.h
• VclistCell_dtor() : vclist.h
• VclistCell_dtor2() : vclist.h
• VCM_BSPL2 : vhal.h
• VCM_TRIL : vhal.h
• Vcsm : vcsm.h
• Vcsm_ctor() : vcsm.h
• Vcsm_ctor2() : vcsm.h
• Vcsm_dtor() : vcsm.h
• Vcsm_dtor2() : vcsm.h
• Vcsm_getAtom() : vcsm.h
• Vcsm_getAtomIndex() : vcsm.h
• Vcsm_getNumberAtoms() : vcsm.h
• Vcsm_getNumberSimplices() : vcsm.h
• Vcsm_getSimplex() : vcsm.h
• Vcsm_getSimplexIndex() : vcsm.h
• Vcsm_getValist() : vcsm.h
• Vcsm_init() : vcsm.h
• Vcsm_memChk() : vcsm.h
• Vcsm_update() : vcsm.h
• Vdata_Format : vhal.h
• Vdata_Type : vhal.h
• VDF_AVS : vhal.h
• VDF_DX : vhal.h
• VDF_UHBD : vhal.h
• VDT_CHARGE : vhal.h
• VDT_DIELX : vhal.h
• VDT_DIELY : vhal.h
• VDT_DIELZ : vhal.h
• VDT_EDENS : vhal.h
• VDT_IVDW : vhal.h
• VDT_KAPPA : vhal.h
• VDT_LAP : vhal.h
• VDT_NDENS : vhal.h
• VDT_POT : vhal.h
• VDT_QDENS : vhal.h
• VDT_SMOL : vhal.h
• VDT_SSPL : vhal.h
• VDT_VDW : vhal.h
• VEMBED : vhal.h
• VF77_MANGLE : vhal.h
• Vfetk : vfetk.h
• Vfetk_ctor() : vfetk.h
• Vfetk_ctor2() : vfetk.h
• Vfetk_dqmEnergy() : vfetk.h
• Vfetk_dtor() : vfetk.h
• Vfetk_dtor2() : vfetk.h
• Vfetk_dumpLocalVar() : vfetk.h
• Vfetk_energy() : vfetk.h
• Vfetk_externalUpdateFunction() : vfetk.h
• Vfetk_fillArray() : vfetk.h
• Vfetk_genCube() : vfetk.h
• Vfetk_getAM() : vfetk.h
• Vfetk_getAtomColor() : vfetk.h
• Vfetk_getGem() : vfetk.h
• Vfetk_getSolution() : vfetk.h
• Vfetk_getVcsm() : vfetk.h
• Vfetk_getVpbe() : vfetk.h
• Vfetk_GuessType : vfetk.h
• Vfetk_LocalVar : vfetk.h
• Vfetk_LsolvType : vfetk.h
• Vfetk_memChk() : vfetk.h
• Vfetk_NsolvType : vfetk.h
• Vfetk_PDE_bisectEdge() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_ctor() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_ctor2() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_delta() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_DFu_wv() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_dtor() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_dtor2() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_Fu() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_Fu_v() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_initAssemble() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_initElement() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_initFace() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_initPoint() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_Ju() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_mapBoundary() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_markSimplex() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_oneChart() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_simplexBasisForm() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_simplexBasisInit() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_u_D() : vfetk.h
• Vfetk_PDE_u_T() : vfetk.h
• Vfetk_PrecType : vfetk.h
• Vfetk_qfEnergy() : vfetk.h
• Vfetk_readMesh() : vfetk.h
• Vfetk_setAtomColors() : vfetk.h
• Vfetk_setParameters() : vfetk.h
• Vfetk_write() : vfetk.h
• VFLOOR : vhal.h
• Vgreen : vgreen.h
• Vgreen_coulomb() : vgreen.h
• Vgreen_coulomb_direct() : vgreen.h
• Vgreen_coulombD() : vgreen.h
• Vgreen_coulombD_direct() : vgreen.h
• Vgreen_ctor() : vgreen.h
• Vgreen_ctor2() : vgreen.h
• Vgreen_dtor() : vgreen.h
• Vgreen_dtor2() : vgreen.h
• Vgreen_getValist() : vgreen.h
• Vgreen_helmholtz() : vgreen.h
• Vgreen_helmholtzD() : vgreen.h
• Vgreen_memChk() : vgreen.h
• Vgrid : vgrid.h
• Vgrid_ctor() : vgrid.h
• Vgrid_ctor2() : vgrid.h
• Vgrid_curvature() : vgrid.h
• VGRID_DIGITS : vgrid.h
• Vgrid_dtor() : vgrid.h
• Vgrid_dtor2() : vgrid.h
• Vgrid_gradient() : vgrid.h
• Vgrid_integrate() : vgrid.h
• Vgrid_memChk() : vgrid.h
• Vgrid_normH1() : vgrid.h
• Vgrid_normL1() : vgrid.h
• Vgrid_normL2() : vgrid.h
• Vgrid_normLinf() : vgrid.h
• Vgrid_readDX() : vgrid.h
• Vgrid_seminormH1() : vgrid.h
• Vgrid_value() : vgrid.h
• Vgrid_writeDX() : vgrid.h
• Vgrid_writeUHBD() : vgrid.h
• VGT_DIRI : vfetk.h
• VGT_PREV : vfetk.h
• VGT_ZERO : vfetk.h
• Vhal_PBEType : vhal.h
• VLT_BCG : vfetk.h
• VLT_CG : vfetk.h
• VLT_MG : vfetk.h
• VLT_SLU : vfetk.h
• VMGNLEV : vhal.h
• Vmgrid : vmgrid.h
• Vmgrid_addGrid() : vmgrid.h
• Vmgrid_ctor() : vmgrid.h
• Vmgrid_ctor2() : vmgrid.h
• Vmgrid_curvature() : vmgrid.h
• Vmgrid_dtor() : vmgrid.h
• Vmgrid_dtor2() : vmgrid.h
• Vmgrid_getGridByNum() : vmgrid.h
• Vmgrid_getGridByPoint() : vmgrid.h
• Vmgrid_gradient() : vmgrid.h
• Vmgrid_value() : vmgrid.h
• VMGRIDMAX : vmgrid.h
• VNT_ARC : vfetk.h
• VNT_INC : vfetk.h
• VNT_NEW : vfetk.h
• Vopot : vopot.h
• Vopot_ctor() : vopot.h
• Vopot_ctor2() : vopot.h
• Vopot_curvature() : vopot.h
• Vopot_dtor() : vopot.h
• Vopot_dtor2() : vopot.h
• Vopot_gradient() : vopot.h
• Vopot_pot() : vopot.h
• Vparam : vparam.h
• Vparam_AtomData : vparam.h
• Vparam_AtomData_copyFrom() : vparam.h
• Vparam_AtomData_copyTo() : vparam.h
• Vparam_AtomData_ctor() : vparam.h
• Vparam_AtomData_ctor2() : vparam.h
• Vparam_AtomData_dtor() : vparam.h
• Vparam_AtomData_dtor2() : vparam.h
• Vparam_ctor() : vparam.h
• Vparam_ctor2() : vparam.h
• Vparam_dtor() : vparam.h
• Vparam_dtor2() : vparam.h
• Vparam_getAtomData() : vparam.h
• Vparam_getResData() : vparam.h
• Vparam_memChk() : vparam.h
• Vparam_readFlatFile() : vparam.h
• Vparam_ResData : vparam.h
• Vparam_ResData_ctor() : vparam.h
• Vparam_ResData_ctor2() : vparam.h
• Vparam_ResData_dtor() : vparam.h
• Vparam_ResData_dtor2() : vparam.h
• Vpbe : vpbe.h
• Vpbe_ctor() : vpbe.h
• Vpbe_ctor2() : vpbe.h
• Vpbe_dtor() : vpbe.h
• Vpbe_dtor2() : vpbe.h
• Vpbe_getBulkIonicStrength() : vpbe.h
• Vpbe_getCoulombEnergy1() : vpbe.h
• Vpbe_getDeblen() : vpbe.h
• Vpbe_getGamma() : vpbe.h
• Vpbe_getIons() : vpbe.h
• Vpbe_getMaxIonRadius() : vpbe.h
• Vpbe_getSoluteCenter() : vpbe.h
• Vpbe_getSoluteCharge() : vpbe.h
• Vpbe_getSoluteDiel() : vpbe.h
• Vpbe_getSoluteRadius() : vpbe.h
• Vpbe_getSoluteXlen() : vpbe.h
• Vpbe_getSoluteYlen() : vpbe.h
• Vpbe_getSoluteZlen() : vpbe.h
• Vpbe_getSolventDiel() : vpbe.h
• Vpbe_getSolventRadius() : vpbe.h
• Vpbe_getTemperature() : vpbe.h
• Vpbe_getVacc() : vpbe.h
• Vpbe_getValist() : vpbe.h
• Vpbe_getXkappa() : vpbe.h
• Vpbe_getZkappa2() : vpbe.h
• Vpbe_getZmagic() : vpbe.h
• Vpbe_memChk() : vpbe.h
• Vpee : vpee.h
• Vpee_ctor() : vpee.h
• Vpee_ctor2() : vpee.h
• Vpee_dtor() : vpee.h
• Vpee_dtor2() : vpee.h
• Vpee_markRefine() : vpee.h
• Vpee_numSS() : vpee.h
• Vpmg : vpmg.h
• Vpmg_ctor() : vpmg.h
• Vpmg_ctor2() : vpmg.h
• Vpmg_dbnpForce() : vpmg.h
• Vpmg_dielEnergy() : vpmg.h
• Vpmg_dielGradNorm() : vpmg.h
• Vpmg_dtor() : vpmg.h
• Vpmg_dtor2() : vpmg.h
• Vpmg_energy() : vpmg.h
• Vpmg_fillArray() : vpmg.h
• Vpmg_fillco() : vpmg.h
• Vpmg_force() : vpmg.h
• Vpmg_ibForce() : vpmg.h
• Vpmg_memChk() : vpmg.h
• Vpmg_npEnergy() : vpmg.h
• Vpmg_printColComp() : vpmg.h
• Vpmg_qfAtomEnergy() : vpmg.h
• Vpmg_qfEnergy() : vpmg.h
• Vpmg_qfForce() : vpmg.h
• Vpmg_qmEnergy() : vpmg.h
• Vpmg_setPart() : vpmg.h
• Vpmg_solve() : vpmg.h
• Vpmg_solveLaplace() : vpmg.h
• Vpmg_unsetPart() : vpmg.h
• VPMGMAXPART : vpmg.h
• Vpmgp : vpmgp.h
• Vpmgp_ctor() : vpmgp.h
• Vpmgp_ctor2() : vpmgp.h
• Vpmgp_dtor() : vpmgp.h
• Vpmgp_dtor2() : vpmgp.h
• VPMGSMALL : vhal.h
• VPT_DIAG : vfetk.h
• VPT_IDEN : vfetk.h
• VPT_MG : vfetk.h
• VREDFRAC : vhal.h
• VSM_MOL : vhal.h
• VSM_MOLSMOOTH : vhal.h
• VSM_SPLINE : vhal.h
• Vstring_isdigit() : vstring.h
• Vstring_strcasecmp() : vstring.h
• Vsurf_Meth : vhal.h
• Vunit_amu_to_kg : vunit.h
• Vunit_C_to_ec : vunit.h
• Vunit_cal_to_J : vunit.h
• Vunit_ec : vunit.h
• Vunit_ec_to_C : vunit.h
• Vunit_eps0 : vunit.h
• Vunit_esu_ec2A : vunit.h
• Vunit_esu_kb : vunit.h
• Vunit_J_to_cal : vunit.h
• Vunit_kb : vunit.h
• Vunit_kg_to_amu : vunit.h
• Vunit_Na : vunit.h
• Vunit_pi : vunit.h

- w -

• writedataFE() : routines.h
• writedataMG() : routines.h
• writematMG() : routines.h

---